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Twist Bioscience 推出 FlexPrep? 超高通量文庫(kù)制備試劑盒,適用于農(nóng)業(yè)基因組學(xué)和群體基因組學(xué)應(yīng)用
來(lái)源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時(shí)間: 2024-11-13 | 267 次瀏覽 | 分享到:

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Twist Bioscience公司推出的FlexPrep? 超高通量文庫(kù)制備試劑盒,通過(guò)引入新穎的 Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù),改進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)酶促片段化文庫(kù)制備方法,以低成本實(shí)現(xiàn)高通量,旨在加速芯片用戶(hù)在群體基因組學(xué)和農(nóng)業(yè)基因組學(xué)領(lǐng)域的NGS研究。

Twist FlexPrep? 超高通量(UHT)文庫(kù)制備試劑盒

Twist FlexPrep ? 超高通量(UHT)文庫(kù)制備試劑盒的工作流程旨在為簡(jiǎn)化和大規(guī)模擴(kuò)展 Twist 已建立的酶切方法而設(shè)計(jì)。Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù)消除了在文庫(kù)制備前對(duì)每個(gè)DNA樣本進(jìn)行定量和對(duì)大量人工耗費(fèi)的需要,從而大大節(jié)省了每個(gè)樣本的成本。在多孔板中對(duì)每個(gè)樣本進(jìn)行片段化和接頭連接后,*多可以將12個(gè)樣本合并到一個(gè)管中,顯著減少后續(xù)磁珠純化和擴(kuò)增步驟所需的試劑用量和成本??衫么嗽噭┖兄苽涞奈膸?kù),使用靶向富集組合進(jìn)行全基因組或靶向測(cè)序。所有多孔板和管式都經(jīng)過(guò)優(yōu)化,以確保與關(guān)鍵自動(dòng)化系統(tǒng)兼容,這對(duì)于希望簡(jiǎn)化工作流程并減少動(dòng)手時(shí)間的實(shí)驗(yàn)室來(lái)說(shuō)是一個(gè)關(guān)鍵考慮因素。

關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)

集成的NBL技術(shù)

? 消除前期歸一化處理

? 無(wú)需中間定量

? 樣品起始量區(qū)間寬泛(30ng-300ng)

早期混樣節(jié)省成本

? 接頭連接反應(yīng)之后將96個(gè)樣本合并到8管中

? 降低上游反應(yīng)體積

? 減少下游反應(yīng)耗材

專(zhuān)為超高容量多重測(cè)序而生

? 單個(gè)試劑盒多達(dá)1152個(gè)UDIs

? 反應(yīng)數(shù)量擴(kuò)大12倍

? 每個(gè)靶向富集反應(yīng)可支持96個(gè)樣本

數(shù)據(jù)展示

消除前期歸一化和中間定量樣品

Twist FlexPrep UHT文庫(kù)制備試劑盒采用新穎的 Normalization by Ligation(NBL)技術(shù),消除了前期和中間樣品定量的需要,簡(jiǎn)化了測(cè)序工作流程(圖1)。

專(zhuān)為節(jié)省成本且不影響質(zhì)量而構(gòu)建的工作流程

FlexPrep標(biāo)準(zhǔn)化接頭包含12個(gè)內(nèi)聯(lián)條形碼,它允許超高通量和自動(dòng)化友好的多重測(cè)序策略(圖2)。

Twist FlexPrep UHT文庫(kù)制備試劑盒,通過(guò)在一個(gè)試劑盒的單次測(cè)序中運(yùn)行多達(dá)1152個(gè)樣本來(lái)實(shí)現(xiàn)測(cè)序通量*大化,這種提高效率的策略可以轉(zhuǎn)化為節(jié)省試劑、耗材和時(shí)間成本。與單獨(dú)處理樣本相比,F(xiàn)lexPrep?將使用的耗材減少了12倍,并將移液器吸頭的數(shù)量從標(biāo)準(zhǔn)試劑盒中使用的17,000多個(gè)減少到FlexPrep? UHT試劑盒中使用的不到4,000個(gè)。

Twist FlexPrep UHT產(chǎn)量均一,且插入片段尺寸穩(wěn)定

Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit支持30 ng至300 ng的起始量范圍,對(duì)全基因組測(cè)序(WGS)或靶向富集(TE)的均勻性和插入片段尺寸的影響*小(如圖3和圖4)。

通過(guò)靶向富集確定感興趣區(qū)域

FlexPrep的工作流程也可以擴(kuò)展到靶向富集,其中單個(gè)富集反應(yīng)可用于多達(dá)96個(gè)樣品。

與其他Twist文庫(kù)制備試劑盒一樣,F(xiàn)lexPrep UHT生成的高復(fù)雜性文庫(kù)在靶向富集后具有均勻的覆蓋率(表1)。結(jié)合Twsit定制Panel,以實(shí)現(xiàn)對(duì)感興趣的基因組區(qū)域的可調(diào)控且均勻的覆蓋。