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甲基化檢測:DNA重亞硫酸鹽快速轉(zhuǎn)化
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時(shí)間: 2023-04-18 | 3036 次瀏覽 | 分享到:

表觀遺傳學(xué)是研究在基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達(dá)和調(diào)控的可遺傳變化的一門遺傳學(xué)分支學(xué)科。表觀遺傳的現(xiàn)象很多,比如RNA介導(dǎo)的基因沉默,組蛋白修飾,DNA甲基化等。其中,DNA的甲基化作為高等真核生物中一個(gè)主要的表觀遺傳學(xué)機(jī)制,被廣泛研究。

近年來涌現(xiàn)出很多 DNA 甲基化的檢測技術(shù),常用的DNA甲基化檢測方式主要是基于亞硫酸鹽修飾預(yù)處理的甲基化檢測技術(shù)。

(重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化原理)

天根生化針對DNA甲基化研究中的DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化開發(fā)一款全新試劑盒。

DNA重亞硫酸鹽快速轉(zhuǎn)化試劑盒(離心柱型)(DP225)

簡單快速:轉(zhuǎn)化和純化流程可在2 h內(nèi)完成,對儀器設(shè)備要求較低,操作簡便。

轉(zhuǎn)化率高:DNA樣品中未甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶的轉(zhuǎn)化率可達(dá)99.5%以上。

反應(yīng)靈敏:DNA樣品適用濃度范圍在500 pg~2.5 μg之間。

完整度高:處理后的DNA完整度好,得率高。

普適性好:本試劑盒處理后的DNA樣品適用于甲基化特異性PCR,測序法及芯片法等后續(xù)甲基化分析方法。


實(shí)驗(yàn)流程

重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化

1. Bisulfite Mix-L3干粉溶解

2. 重亞硫酸鹽反應(yīng)體系配制

3. 重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化循環(huán)條件


表1重亞硫酸鹽反應(yīng)體系

表2重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化循環(huán)條件

重亞硫酸鹽處理后的 DNA純化

DP225  實(shí)驗(yàn)案例一

轉(zhuǎn)化時(shí)間和轉(zhuǎn)化試劑體積對轉(zhuǎn)化率的影響


DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒轉(zhuǎn)化率評估實(shí)驗(yàn)流程

重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化循環(huán)條件

轉(zhuǎn)化時(shí)間和轉(zhuǎn)化試劑體積對轉(zhuǎn)化率的影響

實(shí)驗(yàn)結(jié)論:

用天根DNA重亞硫酸鹽快速轉(zhuǎn)化試劑盒DP225轉(zhuǎn)化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比較了不同轉(zhuǎn)化試劑體積(100 μl和120 μl)和不同轉(zhuǎn)化時(shí)間(50 min (2 cycles), 75 min (3 cycles)和100 min (4 cycles))對轉(zhuǎn)化率的影響,轉(zhuǎn)化率通過NGS方法評估(流程見上表)。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)化試劑體積為120 μl時(shí),相比100 μl得到更高的轉(zhuǎn)化率;轉(zhuǎn)化時(shí)間為100 min (4 cycles)時(shí) ,相比于更短的轉(zhuǎn)化時(shí)間(50 min (2 cycles)和75 min (3 cycles)),得到更高的轉(zhuǎn)化率。


DP225  實(shí)驗(yàn)案例二


不同品牌的同類產(chǎn)品轉(zhuǎn)化率比較

DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒轉(zhuǎn)化率評估實(shí)驗(yàn)流程

不同品牌的DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒的轉(zhuǎn)化率比較


實(shí)驗(yàn)結(jié)論:

用天根DNA重亞硫酸鹽快速轉(zhuǎn)化試劑盒DP225和國際主流品牌同類產(chǎn)品轉(zhuǎn)化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比較各產(chǎn)品的轉(zhuǎn)化率,轉(zhuǎn)化率通過NGS方法評估(流程見上表)。結(jié)果顯示,DP225具有高的轉(zhuǎn)化率,性能與國際品牌相當(dāng)甚至更優(yōu)。


重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化后的下游分析


PyroSequencing焦磷酸測序

Sanger測序

建庫測序、捕獲測序、芯片、panel

甲基化特異性PCR-EM101

高分辨率熔解曲線分析-FP210

探針法qPCR-FP211,FP206 


訂購信息

產(chǎn)品名稱

貨號

規(guī)格

DNA重亞硫酸鹽快速轉(zhuǎn)化試劑盒

DP225

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